「パズル研究所」は、「博士のメカメカ大作戦」セットのリリースと共に追加された、ドクター・ブームの研究所を舞台にした1人用のプレイ・モードです。

4つのテーマに分けられた、合計100種類以上ものパズルをプレイヤーに解かせるコンテンツとなっています。

1つのパズルをクリアすると速やかに次のパズル・ステージに移行したり、リセット・ボタンによってリトライが容易となるなど、パズルの挑戦を何度でも繰り返しやすい工夫が施されています。

それぞれのテーマのステージを全てクリアすると、ドクター・ブームが相手となる最難関の「ブーム・パズル」への入場ができるようになります。

「ブーム・パズル」を全て解くと、報酬として「メカメカ大作戦！」のCard Back（カード裏面デザイン）が与えられます。

この投稿で扱うパズルのテーマは「盤面クリア」です。

文字通りに、盤面に存在するミニオンを全て除去するパズルです。

プレイヤーは、与えられたマナや手札カードなどを駆使して、敵味方の両方のミニオンを一つ残らず破壊することを目指します。

ボスは樹木学者デクスター、プルンプルン・フループ、悪魔学者ドラーン、ドクター・モリガンの4体であり、1体のボスごとに複数のパズル・ステージが用意されています。

後者のボスになるほど難度が高まります。